Showing metabocard for Paenialvin A (MMDBc0021753)
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| Version | 2.0 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Quantified | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2021-05-15 11:54:23 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2025-10-07 16:07:09 UTC | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite ID | MMDBc0021753 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite Identification | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | Paenialvin A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Paenialvin A is a peptide antibiotic belonging to the class of cyclic lipopeptides. Its chemical structure comprises a cyclic arrangement of amino acids, which contributes to its stability and antimicrobial properties. Paenialvin A is produced by the bacterium Paenibacillus alvei DSM 29, alongside three other related peptides, collectively referred to as paenialvins A-D (PMID:29760411 ). Mass spectrometry analysis has revealed that paenialvin A has a molecular mass of 1891 Da (PMID:29760411 ). The compound exhibits significant antimicrobial activity against a range of pathogenic bacteria, including methicillin-resistant Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis, Loktanella hongkongensis, Escherichia coli, and Pseudomonas aeruginosa (PMID:29760411 ). The biosynthetic pathways involved in the production of paenialvin A are likely to include non-ribosomal peptide synthesis, which is a common mechanism for the generation of peptide antibiotics. This pathway allows for the incorporation of non-standard amino acids and the formation of complex structures that enhance the antimicrobial efficacy of the compound. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Formula | C90H166N22O21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Mass | 1892.451 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 1891.259790453 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | 6-amino-N-(1-{[(9R,15S)-3,6-bis(4-aminobutyl)-5,8,11,14-tetrahydroxy-9-(hydroxymethyl)-16-methyl-12-(2-methylpropyl)-2-oxo-1-oxa-4,7,10,13-tetraazacyclohexadeca-4,7,10,13-tetraen-15-yl]-C-hydroxycarbonimidoyl}-3-methylbutyl)-2-{[(2R)-2-({2-[(2-{[(2R)-5-carbamimidamido-1-hydroxy-2-{[(2S)-1-hydroxy-2-({1-hydroxy-2-[(1-hydroxy-2-{[(2R)-1-hydroxy-2-({1-hydroxy-4-methyl-2-[(1,2,3-trihydroxypropylidene)amino]pentylidene}amino)propylidene]amino}-4-methylpentylidene)amino]-4-methylpentylidene}amino)-3-methylpentylidene]amino}pentylidene]amino}-1-hydroxy-4-methylpentylidene)amino]-1-hydroxy-4-methylpentylidene}amino)-1-hydroxy-3-methylbutylidene]amino}hexanimidic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | 6-amino-N-(1-{[(9R,15S)-3,6-bis(4-aminobutyl)-5,8,11,14-tetrahydroxy-9-(hydroxymethyl)-16-methyl-12-(2-methylpropyl)-2-oxo-1-oxa-4,7,10,13-tetraazacyclohexadeca-4,7,10,13-tetraen-15-yl]-C-hydroxycarbonimidoyl}-3-methylbutyl)-2-{[(2R)-2-({2-[(2-{[(2R)-5-carbamimidamido-1-hydroxy-2-{[(2S)-1-hydroxy-2-({1-hydroxy-2-[(1-hydroxy-2-{[(2R)-1-hydroxy-2-({1-hydroxy-4-methyl-2-[(1,2,3-trihydroxypropylidene)amino]pentylidene}amino)propylidene]amino}-4-methylpentylidene)amino]-4-methylpentylidene}amino)-3-methylpentylidene]amino}pentylidene]amino}-1-hydroxy-4-methylpentylidene)amino]-1-hydroxy-4-methylpentylidene}amino)-1-hydroxy-3-methylbutylidene]amino}hexanimidic acid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [H]C(C)(CC)[C@]([H])(N=C(O)C([H])(CC(C)C)N=C(O)C([H])(CC(C)C)N=C(O)[C@@]([H])(C)N=C(O)C([H])(CC(C)C)N=C(O)C([H])(O)CO)C(O)=N[C@]([H])(CCCNC(N)=N)C(O)=NC([H])(CC(C)C)C(O)=NC([H])(CC(C)C)C(O)=N[C@]([H])(C(C)C)C(O)=NC([H])(CCCCN)C(O)=NC([H])(CC(C)C)C(O)=N[C@]1([H])C(O)=NC([H])(CC(C)C)C(O)=N[C@]([H])(CO)C(O)=NC([H])(CCCCN)C(O)=NC([H])(CCCCN)C(=O)OC1([H])C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C90H166N22O21/c1-21-54(18)71(111-82(125)66(42-51(12)13)106-78(121)62(38-47(4)5)102-73(116)55(19)97-77(120)61(37-46(2)3)107-85(128)69(115)45-114)87(130)100-59(32-28-36-96-90(94)95)76(119)103-63(39-48(6)7)79(122)105-65(41-50(10)11)81(124)110-70(53(16)17)86(129)99-58(30-23-26-34-92)75(118)104-67(43-52(14)15)83(126)112-72-56(20)133-89(132)60(31-24-27-35-93)101-74(117)57(29-22-25-33-91)98-84(127)68(44-113)109-80(123)64(40-49(8)9)108-88(72)131/h46-72,113-115H,21-45,91-93H2,1-20H3,(H,97,120)(H,98,127)(H,99,129)(H,100,130)(H,101,117)(H,102,116)(H,103,119)(H,104,118)(H,105,122)(H,106,121)(H,107,128)(H,108,131)(H,109,123)(H,110,124)(H,111,125)(H,112,126)(H4,94,95,96)/t54?,55-,56?,57?,58?,59-,60?,61?,62?,63?,64?,65?,66?,67?,68-,69?,70-,71+,72+/m1/s1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | AAYWFUPQOIAEBF-FIFUHQDSSA-N | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as cyclic depsipeptides. These are natural or synthetic compounds having sequences of amino and hydroxy carboxylic acid residues (usually α-amino and α-hydroxy acids) connected in a ring. The residues are commonly but not necessarily regularly alternating. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organic acids and derivatives | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Peptidomimetics | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Depsipeptides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Cyclic depsipeptides | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents |
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| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic heteromonocyclic compounds | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Expected Solid | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| Spectra | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Chromatographic Retention Times and Retention Indices | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Retention Times |
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| Retention Indices | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biospecimen Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Proteins and Enzymes | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Human Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Microbial Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolic Reactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions This table shows at most 20 reactions. For the full list of associated reactions: See All Associated Reactions
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| Health Effects and Bioactivity | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Microbial Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Exposure Sources | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other Exposures |
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| Host Biospecimen and Location | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| External Links | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 78445624 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 139589552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CMMC Knowledgebase | Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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