Showing metabocard for cob(II)inamide (MMDBc0055825)
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| Version | 2.0 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Status | Detected and Quantified | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Creation Date | 2022-06-17 20:07:54 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Update Date | 2025-10-07 16:09:23 UTC | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite ID | MMDBc0055825 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolite Identification | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Common Name | cob(II)inamide | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | cob(II)inamide is a cobalt-containing metabolite classified as a member of the cobalamin (vitamin B12) chemical class. Its chemical structure features a cobalt ion coordinated to a corrin ring, which is characteristic of cobalamin derivatives. In biochemical pathways, cob(II)inamide serves as a precursor to cob(II)alamin and is involved in various enzymatic reactions. For instance, studies have shown that EutT, an enzyme, interacts with cob(II)inamide during the reduction of Co(II)Cbl, highlighting its role in substrate specificity and mechanism (PMID:30071158 ). Additionally, cob(II)inamide does not promote ligand dissociation in the presence of EutT, indicating its stability as a substrate analogue (PMID:25914129 ). Furthermore, it has been observed that cob(II)inamide can form derivatives through interactions with coenzyme analogs, which lack the nucleotide moiety, leading to the cleavage of the cobalt-carbon bond (PMID:9537996 ). Its reactivity has been explored in the context of radical chemistry, where it participates in alkylation reactions and exhibits diastereomeric preferences (PMID:11669778 ). Overall, cob(II)inamide plays a significant role in the chemistry of cobalamin derivatives and their associated biological pathways. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Structure | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Synonyms | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Formula | C48H72CoN11O8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Average Mass | 990.106 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Monoisotopic Mass | 989.489179 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IUPAC Name | lambda2-cobalt(2+) ion 3-[(1R,2R,3S,4S,8S,9S,14S,18R,19R)-4,14-bis[2-(C-hydroxycarbonimidoyl)ethyl]-3,8,19-tris[(C-hydroxycarbonimidoyl)methyl]-18-(2-{[(2R)-2-hydroxypropyl]-C-hydroxycarbonimidoyl}ethyl)-2,3,6,8,13,13,16,18-octamethyl-20,21,22,23-tetraazapentacyclo[15.2.1.1^{2,5}.1^{7,10}.1^{12,15}]tricosa-5,7(22),10,12(21),15,17(20)-hexaen-9-yl]propan-1-aminide | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Traditional Name | lambda2-cobalt(2+) ion 3-[(1R,2R,3S,4S,8S,9S,14S,18R,19R)-4,14-bis[2-(C-hydroxycarbonimidoyl)ethyl]-3,8,19-tris(C-hydroxycarbonimidoylmethyl)-18-(2-{[(2R)-2-hydroxypropyl]-C-hydroxycarbonimidoyl}ethyl)-2,3,6,8,13,13,16,18-octamethyl-20,21,22,23-tetraazapentacyclo[15.2.1.1^{2,5}.1^{7,10}.1^{12,15}]tricosa-5,7(22),10,12(21),15,17(20)-hexaen-9-yl]propan-1-aminide | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CAS Registry Number | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SMILES | [Co++].[H][C@](C)(O)CN=C(O)CC[C@@]1(C)C2=N[C@]([H])([C@]1([H])CC(O)=N)[C@]1(C)NC(=C(C)C3=NC(=CC4=NC(=C2C)[C@@]([H])(CCC(O)=N)C4(C)C)[C@@]([H])(CCC([NH-])=O)[C@]3(C)CC(O)=N)[C@@]([H])(CCC(O)=N)[C@]1(C)CC(O)=N | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Identifier | InChI=1S/C48H73N11O8.Co/c1-23(60)22-55-38(67)16-17-45(6)29(18-35(52)64)43-48(9)47(8,21-37(54)66)28(12-15-34(51)63)40(59-48)25(3)42-46(7,20-36(53)65)26(10-13-32(49)61)30(56-42)19-31-44(4,5)27(11-14-33(50)62)39(57-31)24(2)41(45)58-43;/h19,23,26-29,43,60H,10-18,20-22H2,1-9H3,(H14,49,50,51,52,53,54,55,56,57,58,59,61,62,63,64,65,66,67);/q;+2/p-1/t23-,26-,27-,28-,29+,43-,45-,46+,47+,48+;/m1./s1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| InChI Key | GFVWZOGCSKVPRA-JFYQDRLCSA-M | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemical Taxonomy | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description | Belongs to the class of organic compounds known as metallotetrapyrroles. These are polycyclic compounds containing a tetrapyrrole skeleton combined with a metal atom. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Kingdom | Organic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Super Class | Organoheterocyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Class | Tetrapyrroles and derivatives | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sub Class | Metallotetrapyrroles | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Direct Parent | Metallotetrapyrroles | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Alternative Parents |
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| Substituents |
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| Molecular Framework | Aliphatic heteropolycyclic compounds | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| External Descriptors | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Functional Ontology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Physical Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| State | Expected Solid | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Predicted Properties |
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| Spectra | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Not Available | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chromatographic Retention Times and Retention Indices | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Retention Times | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Retention Indices | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biological Properties | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Biospecimen Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue Locations | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Associated OMIM IDs | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Human Proteins and Enzymes | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Human Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways |
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| Microbial Pathways | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Pathways | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Metabolic Reactions | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Reactions This table shows at most 20 reactions. For the full list of associated reactions: See All Associated Reactions
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| Health Effects and Bioactivity | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Microbial Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Exposure Sources | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Other Exposures |
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| Host Biospecimen and Location | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| External Links | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| HMDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DrugBank ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Phenol Explorer Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| FooDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KNApSAcK ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Chemspider ID | 4573794 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| KEGG Compound ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BioCyc ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| BiGG ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikipedia Link | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| METLIN ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PubChem Compound | 5460147 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| PDB ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ChEBI ID | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Food Biomarker Ontology | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| CMMC Knowledgebase | Not Available | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| General References | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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